Zmień kolor punktu i kolor ramki/elipsy wokół punktów
Chcę zacząć od stwierdzenia, że jestem początkującym użytkownikiem języka R, a zwłaszcza tej witryny, więc jeśli chcesz coś tutaj wyjaśnić, daj mi znać! Jeszcze tego nie rozumiem, więc nie krępuj się, aby jak najbardziej „ogłupiać”.
P: Chcę stworzyć grafikę PCA reprezentującą dwie grupy (w tym przypadku widoki). Chcę też narysować wokół nich elipsy lub ramki.
Na szczęście wykonałem to zadanie za pomocą ggplot2!
Nie mogę jednak zmienić kolorów kropek lub elips/ramek poza wartościami domyślnymi.
Czy mógłbyś zaoferować pomoc w tej sprawie?
Zobacz przykładowy kod poniżej, który jest tylko tradycyjnym zestawem danych tęczówki często używanym w przykładach PCA.
###load in plackages###
library(ggbiplot)
library(ggfortify)
library(cluster)#my actual data is very similar to the iris data, though in my data the "Species" column is first
head(iris)
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
4 4.6 3.1 1.5 0.2 setosa
5 5.0 3.6 1.4 0.2 setosa
6 5.4 3.9 1.7 0.4 setosa
df <- iris[c(1, 2, 3, 4)]
autoplot(prcomp(df))
autoplot(prcomp(df), data = iris, colour = 'Species') #pca graph with species depicted in different colors
autoplot(prcomp(df), data = iris, colour = 'Species', shape='Species', frame=T)
Nie znaleziono powiązanych wyników
Zaproszony:
Aby odpowiedzieć na pytania, Zaloguj się lub Zarejestruj się
2 odpowiedzi
Anonimowy użytkownik
Potwierdzenie od:
Teraz robisz zwykły wykres i zmieniasz parametry jak zwykle
https://i.stack.imgur.com/RMdrH.png
Sprawdź także dla ramki
EDIT
Pomyślałem, że dodanie ramki powinno być łatwiejsze, sprawdź tutaj
https://stats.stackexchange.co ... plot2
https://stats.stackexchange.co ... lot2i tu
ggplot2: geom_polygon bez wypełnienia
https://coderoad.ru/25449093/
Nadal uważam, że ggbiplot powinien obsługiwać i , czy mógłbyś zaktualizować swoje pytanie, które nie działa?
Anonimowy użytkownik
Potwierdzenie od:
Odpowiedź nie była całkowicie ukryta w tych przykładach, ale stwierdziłem, że scale_color_manual i scale_fill_manual zawierają dokładnie to, czego chciałem: zmień ramki na dowolny kolor, jaki można sobie wyobrazić!
WYKRES PCA W RÓŻNYCH KOLORACH
http://i.stack.imgur.com/U10mX.png
Wielkie dzięki za pomoc! Bardzo wdzięczny, że ta mała (a raczej wyjątkowo duża) grupa jest tutaj!